يهدف برنامج بكالوريوس في العلوم الصيدلية بجامعة الأزهر إلى تخريج صيادلة مؤهلين تأهيلاً عالياً، قادرين على تحضير الأدوية، وصرفها، وتقديم الاستشارات الدوائية للمرضى، وذلك من خلال دراسة العلوم الصيدلانية الأساسية والكلينية، وتطبيقها عملياً في الصيدليات الجامعية والمستشفيات. يربط البرنامج بين العلوم الصيدلانية والدين الإسلامي، مما يشكل شخصية الصيدلي المتكامل الذي يتمتع بوعي ديني وإيمان راسخ، وقادر على تقديم الخدمات الصيدلانية للمرضى بكل إنسانية واحترام.