يهدف برنامج بكالوريوس طب وجراحة الفم والأسنان بجامعة الأزهر إلى تخريج أطباء أسنان مؤهلين تأهيلاً عالياً، قادرين على تشخيص وعلاج أمراض الفم والأسنان، وإجراء العمليات الجراحية الفموية، وذلك من خلال دراسة العلوم الطبية الأساسية والكلينية المتعلقة بالفم والأسنان، وتطبيقها عملياً في عيادات الكلية. يربط البرنامج بين العلوم الطبية والدين الإسلامي، مما يشكل شخصية طبيب الأسنان المتكامل الذي يتمتع بوعي ديني وإيمان راسخ، وقادر على تقديم الرعاية الصحية لمرضى الفم والأسنان بكل إنسانية واحترام.