يهدف برنامج بكالوريوس في العلوم (ميكروبيولوجي) بنات بجامعة الأزهر إلى تخريج متخصصات في علم الأحياء الدقيقة قادرات على دراسة الكائنات الحية الدقيقة مثل البكتيريا والفطريات والفيروسات، وفهم دورها في البيئة والصحة والمرض. يزود البرنامج الطالبات بالمعرفة والمهارات اللازمة لتحديد أنواع الميكروبات، ودراسة سلوكها ووظائفها، وتقييم تأثيرها على الإنسان والبيئة، وتطوير طرق لمكافحتها. يجمع البرنامج بين الدراسة النظرية في مجالات علم الأحياء الدقيقة وعلم المناعة وعلم الوراثة، والتطبيق العملي في مجال العمل المختبري وجمع العينات وتحليلها. يهدف البرنامج إلى تزويد الخريجات بالأساس القوي اللازم للعمل في مجالات الصناعة الدوائية، والزراعة، والبيئة، والبحوث العلمية، مما يجعلهن مؤهلات للمساهمة في تطوير الأدوية واللقاحات، وحماية البيئة، وتحسين الصحة العامة.