يهدف برنامج هندسة المناجم والفلزات بجامعة الأزهر إلى تخريج مهندسين قادرين على استكشاف وتطوير واستغلال الثروات المعدنية، وتصميم وتشغيل المنشآت الصناعية المتعلقة بالمناجم والمعادن. يجمع البرنامج بين الدراسة النظرية في مجالات جيولوجيا التعدين، وميكانيكا الصخور، وعمليات التعدين، ومعالجة الخامات، والسلامة والصحة المهنية، والتدريب العملي في المختبرات والمواقع الحقلية. يهدف البرنامج إلى تزويد الخريجين بالمهارات والمعرفة اللازمة للعمل في شركات التعدين، والمشاريع الصناعية، والاستشارات الهندسية، والمساهمة في تحقيق التنمية المستدامة للقطاع المعدني في مصر.